Po prawie siedmiu sezonach spędzonych w Nowym Sączu doświadczony pomocnik opuszcza szeregi zespołu z Fortuna I ligi.
36 – letni zawodnik zasilił szeregi “Sączersów” w sezonie 2015/2016 i stał się wiodącą postacią w zespole. Jednym z jego największych sukcesów jest awans z Sandecją na poziom Ekstraklasy, gdzie wystąpił 21 razy, zdobywając jednego gola. Wcześniej Maciej Małkowski występował już na najwyższym szczeblu rozgrywkowym w Polsce jako piłkarz Górnika Zabrze, Zagłębia Lubin, GKS-u Bełchatów czy Odry Wodzisław Śląski.
Łącznie Maciej Małkowski wystąpił dla Sandecji w 169. meczach, strzelając w nich 35. bramek. Kontrakt z zawodnikiem został rozwiązany za porozumieniem stron.